接到奈良鹿久的汇报，猿飞日斩震惊了许久，大蛇丸和团藏在私底下勾搭的事情，猿飞日斩多少知道一点，这也是猿飞日斩不愿意传位给大蛇丸的原因。
但是在跟踪根部忍者的途中，发现他联系大蛇丸，然后大蛇丸就离开忍军驻地不知道去了哪里，很快分出去跟踪大蛇丸的忍者也没了踪影，不用说，一定是被大蛇丸灭口了。
那什么事情会让大蛇丸痛下杀手，猿飞日斩明白肯定是大蛇丸有什么见不得人的事情，想想这里面还有团藏掺和，再加上前段时间卡卡西报告说根部有人会木遁，一切线索指向大蛇丸就是重启木遁实验的关键人物。
团藏在这里面估计也只是个配角，不是说团藏不重要，而是根据多年来的交往，猿飞日斩比团藏更了解团藏，就像团藏比猿飞日斩更了解猿飞日斩一样。
团藏害人是一把好手，但是说到搞研究，那还不如他猿飞日斩，更别说青出于蓝的大蛇丸，没有大蛇丸的话，团藏只能是对着一大堆实验用品发呆，在重新启动木遁实验事件中，应该属于提供道具的工具人角色，只有大蛇丸才能真正把实验进行下去。
对爱徒堕落至此痛心不已的猿飞日斩，授权奈良鹿久调动暗部，全权负责调查大蛇丸，务必搞清楚他的问题。
很快，奈良鹿久就找到了木叶附近的大蛇丸实验室，里面的一切让猿飞日斩心都在滴血，真希望这不是真的，是团藏的陷害。
可是这次团藏真没插手，他只是想把祸水引向大蛇丸，又不是直接把大蛇丸拎出来，而且在知道这次是奈良鹿久指挥后，团藏本来想偷偷给个线索，好让火影系早一天发现大蛇丸实验室的想法，立刻就被掐灭了，团藏可不想奈良鹿久怀疑线索的来源，重新把目光投向根部，那根部的亏空什么时候能够填上啊。
原作里大蛇丸搞不人道实验被发现，大概率是因为团藏对于猿飞日斩重新上位，而且暗杀失败之后更加不爽，所以拉上大蛇丸准备搞一波大的，结果大蛇丸沉迷于实验不可自拔，为了满足自身的欲望，朝自己村子下手。
这时候刚好赶上卡卡西揭露团藏暗杀火影的阴谋，一众火影系的核心家族正紧张着，团藏接触过的忍者恨不能查清楚祖宗十八代，然后就发现怎么大蛇丸和团藏这么亲密，再一查，村子的人口失踪案和大蛇丸有关，所以就有了猿飞日斩对大蛇丸堵门又开门的场景。
现在的局势和原来又不一样，因为某只小狗使劲扑腾，自来也没能出门追寻漂亮的大姐姐，在四代雷影重新挑起战火后，被自家老师丢到了战场上。
有了自来也可以用，大蛇丸也不用像原着一样，待在村子里，随时等着去某个战线救火，等到确定大野木要等木叶和云隐打到一定程度才会出手，大蛇丸就被派到了川之国，恐吓一下蠢蠢欲动的罗砂。
不能亲自坐镇指挥部下搬家，导致大蛇丸在木叶附近的秘密基地曝光数量和时间，比起原作来更多更快，损失之大，让大蛇丸敲诈团藏的决心坚如磐石。
除了这个，因为大蛇丸是从外面跑路的，留在村子里的红豆避免了被种草莓的结局，不知道红豆会不会因此分帕克一点丸子吃。
更重要的是，自来也因为需要对抗云隐的Ab兄弟，没法向原来一样，刚浪了一圈回来发现男神跑路，立刻追上去，结果重伤之下满忍界找大姐姐疗伤，直到鸣人要考试了才被找回来。
现在大蛇丸不在木叶，好处是大家通过抄大蛇丸的家，各自赢得了更多的资源，坏处是没有猿飞日斩打伤大蛇丸，面对威名赫赫的三忍之一，木叶一时间找不出能够追击的狠人。
好在这次九尾之乱损失比原来小，猿飞日斩拼拼凑凑之后，集结了几十个暗部忍者小队，用于追查大蛇丸的下落，旗木卡卡西就是其中一队的队长。
各队出发之前猿飞日斩也给他们强调了，这次出发，不要求他们和大蛇丸交手，这不现实，猿飞日斩也不确定这个弟子到底掌握了多少禁术，杀死他都是个难以完成的任务，更别说抓活的。
可是这么个重量级的高手叛逃，木叶也不能不给点反应，虽说木叶是整个忍界在追杀叛忍上最佛系的，但这个节点上也不能划水，万一别人误会木叶已经不行了怎么办。
所以派出一群忍者组队出门，一方面是追查大蛇丸的踪影，起码了解下大蛇丸的落脚点，未来也好有个心理准备，一方面是大张旗鼓地告诉忍界，我们木叶还是有能战斗的人，不要试图趁机占便宜，小心偷鸡不成蚀把米。
得知卡卡西要去追查大蛇丸的下落，帕克也顾不上了解为什么大蛇丸叛逃的剧情偏差这么大，连忙叫上七忍犬一起跟上，虽然帕克觉得八忍犬一起上，应该能赶跑大蛇丸，但就怕卡卡西被大蛇丸打得连通灵的时间都找不到，斗地主最悲哀的就是，明明拿着王炸，结果人家一把全出完，炸的机会都没有。
和卡卡西汇合以后，帕克发现卡卡西小队人员配置还挺不错，因为提前毕业以后，老是一副深沉的样子，宇智波鼬让美琴很担心他的脑部寄生虫有没有带来后遗症，搞得富岳头大不已，正好这段时间搞团藏，和卡卡西搭上线，就把鼬塞进来，让卡卡西带去见见世面，说不定会好点。
鼬克大蛇丸这点帕克是知道的，可是现在7、8岁的鼬能不能威胁到大蛇丸帕克就不知道了，万一给大蛇丸送上一双写轮眼就不太妙了。
所以帕克拉着卡卡西软磨硬泡，让卡卡西答应八忍犬一起行动，不再是等着通灵。
就这帕克还是有点不放心，想了想，把绕着木叶跑步正好跑到大门口的迈特凯拉了过来，八门凯是连斑爷都佩服的存在，区区大蛇丸还不瑟瑟发抖？
卡卡西刚想说这次三代火影的人选里没有凯，帕克就掏出钞票让木叶守门人回去任务大厅，给凯发了个S级的护卫任务，任务是护卫帕克在出村路上的狗身安全。
木叶的守门员拿着跑腿费，愉快地和另一个守门员说好分钱的事情，离开大门去给帕克干活了，有大主顾发任务对木叶是大好事，没人会责怪他擅离职守，只要和同伴商量好就行。
看着因为能出村执行S级任务而在那里傻乐的凯，卡卡西叹口气，知道阻止不了帕克，只好默认帕克小队和卡卡西小队合二为一，一起出门调查叛忍大蛇丸的下落。
另一边，终于没被盯得那么紧的团藏，带着一帮根部忍者也来到木叶城墙的漏洞处：“这次，你们执行的任务是帮助大蛇丸掩盖他逃跑的痕迹，不要让猿飞日斩的追查人员找到大蛇丸，大蛇丸的研究能力是村子不可缺少的部分，我们不能让这么个人才就这样被猿飞日斩毁掉，一切都是为了木叶。”
等着根部忍者从漏洞钻出去，团藏又对甲说：“这次你的任务是去秘密据点等待伊布利一族的人，伊布利一族能够把自身化成烟雾，是迷惑追踪者的好帮手，你需要带着他们阻拦住卡卡西小队，明白了吗？”
甲给团藏重重地一个点头，表示一定完成任务，随后独自出发，前往团藏提供的目的地。
暗部、根部再次为了同一个目标一起向前，就是不知道这次会有什么样的火花碰出，团藏期待着他的根部给他带来胜利的好消息。