到了黄药师祖父这一辈，在高宗绍兴年间做御史。
这一年，奸臣秦桧冤害大忠臣岳飞将军，黄药师的祖父一再上表为岳飞申冤。
高宗皇帝和秦桧大怒，不但不准，还将他贬官——所谓是赐金放还。
可黄药师的祖父也是个执拗不屈的性子，忠心耿耿，便在皇宫大门外大声疾呼，不依不饶地呼吁百官与众百姓一起来保岳飞将军，救国救民！
秦桧恼羞成怒，就将他直接下狱杀了，所有的家属都流放去云南。
所以黄药师其实是在云南丽江出生的……他从小就读了很多书，又练成了极高的武功，从小就诅骂皇帝，说是要推倒宋朝，立志要杀了皇帝与昏庸的当朝大臣为岳飞将军和祖父报仇！
可那个时候，秦桧早就已经死了，高宗皇帝也日渐年老昏庸。
黄药师的父亲还是一直教他忠君事亲的圣贤之道，黄药师听了很不服气，不断跟自己父亲争论，家里人都说他不孝。
后来，黄药师的父亲更是一怒之下，将他赶出了家门。
于是，黄药师从云南回到浙江祖宅。他非但不去考科举，还以武功击毁了庆元府的明伦堂，把当地学官都给揪了出来，狼狈不堪……
还跑到皇宫里和宰相、兵部尚书等衙门外以及衢州南迁孔府门外张贴大告示，指斥朝廷的恶政。说该当图谋北伐，恢复故土，否则愧对祖宗云云。
朝廷大怒，派了几百人马昼夜捕捉黄药师。
可以黄药师的武功，又不正面与禁军应战，打游击的话区区几百人马怎么可能捕捉得到他？
就这样，黄药师的名头在江湖上非常响亮。因为他谤骂朝廷，肆无忌惮，说的都是老百姓心里想说却不敢说的话！就在江湖上得了个“邪怪大侠”的名号。
后来，黄药师的父亲在云南去世，虽然和他关系不和睦，但终究是把所有家财留给了他……再加上浙江祖宅这边的一些产业，黄药师能卖的卖，不能卖的就打包带走。
最后，他离开了陆地，来到东海上寻了一处无人知晓的小岛安顿下来——也就是现在的桃花岛了！
不得不说，黄药师的家族也算是传奇了……
“实际上，在下家族的这一段历史，也算不得什么真正的大秘密。朝堂之上和江湖武林中，有心人只要去打听和探寻一番，总是能知道的。只不过，我桃花岛孤悬海外，和朝堂江湖都已经没有太多瓜葛，一般也没什么人去打听。”
黄药师的声音淡淡的，似乎讲述的是别人家事一般。只是吴云还是从其中听出了一些不甘和怨念。
来自对宋国朝廷的失望，对当年祖父被奸臣所害的不甘，对父子关系不和睦的遗憾……
洪七公沉默了片刻，又道：“不过黄老邪，这些似乎和你说的十三秘丹药方没关系吧？”
“自然有关系！我刚才就说过，这十三张药方是被我叔祖带走。实际上，当年我祖父还有一个弟弟。那是我曾祖父在外地为官时，和一个苗医女子所生。由于既非明媒正娶，又非汉人女子，便一直隐瞒着。我这私生的叔祖便和他母亲生活，长到十二岁才来到黄府。”
“当时黄家在朝堂和士林中都声望正隆，自然不愿声张。但曾祖父也不是绝情之人，就把这私生子收入府中，和我祖父一起成长。说是他的伴读书童，实则是同父异母的兄弟。”
“再之后，我祖父担任御史大夫时为岳飞将军抱不平而被杀。族中人商议，便让我这叔祖离开，以免到时候家族绝后。他本身就不在族谱中，朝廷也不会知晓。”
“于是，我这叔祖便带着这十三张秘丹药方离开黄家，不知所踪了。所幸的时候，狗皇帝倒也没有丧尽天良，杀了我祖父之后，其余人等流放到云南……”
原来如此！！！
吴云惊讶地看着黄药师：“所以，留下这十三张药方的人……是黄兄你那位叔祖？”
“应该是了。”黄药师点点头，“据说那位叔祖医术极高明，武功也还可以。没想到他离家之后，还有这番际遇。只可惜，终究是被那异蛇所害。说到这事，吴弟你击杀那异蛇妖蟒，也算是为我叔祖报仇雪恨了。”
黄药师家族的故事说完了，三人走在密道中，都沉默了。
很快，密道尽头，出现一个密室。
面积颇大，四周墙壁上都挂着许许多多的画像，前面还供着牌位——想必都是黄氏先祖们了。
密室正中心有一个石台，上面放着一些精美古朴的箱子。
黄药师走上前，把左边的一个打开，从里面拿出了四张泛黄的纸卷，递给吴云和洪七公看。
“叔祖离家之后不知所踪，后来局势稳定下来之后，家族族老们想办法靠记忆还原了四张最简单的药方。其余的太过复杂，光是用药就超过上百种，且名字和外形描述极为复杂，所需药草的年份也各不相同，不可能记得住。”
师徒俩接过他递来的药方一对照，果然和吴云的那十三张其中四张几乎是一模一样的！只是极少数几种药材的年份和用量有点微小差距。
估计是当初黄氏族人再记忆默写时，出了一些错误。
吴云思索片刻，笑着道：“既然这十三张药方本就是黄兄祖传之物，你我既已结为异姓兄弟，那么现在便物归原主了吧。”
黄药师却摇摇头。
“这是吴弟你寻到之物，自然是属于你的。为兄只是见到这些祖传之物，心绪起伏，想起前尘旧事，便说与你和洪兄听听而已。”
他确实也并不贪慕这些药方，只是和吴云兴趣相投，觉得命运冥冥中十分神奇，才带他俩来密室一观，并讲出诸多过往。
吴云心念一动，又建议道：“可是黄兄，我和师父虽然勉强懂得一些医术药理，但和你比起来还是差很多。这些药方留在我手里也没用吧。不如这样，能不能拜托你尝试着看看能不能依照药方制作成品出来？到时候，我们五五分如何。”